Otro de los ejes de trabajo que impulsa el Gobierno Nacional en la región es la culminación y posterior mantenimiento de la Troncal Amazónica, proyecto que es fruto de una lucha que el pueblo amazónico ha librado por más de 30 años. Si bien es cierto, administraciones anteriores gestionaron esta red vial, no la concluyeron por falta de decisión política y transparencia, lo cual ha derivado en problemas técnicos y legales.

La Vicepresidencia de la República, coordinando a través del Consejo de Desarrollo Amazónico, con el Ministerio de Transporte y Obras Públicas, impulsa el proyecto. Estas instituciones, bajo el amparo del decreto de emergencia vial, han conseguido reactivar los tramos que se encontraban desfinanciados. La acción efectiva del Gobierno Nacional se evidencia también en el saneamiento de los contratos que fueron mal formulados en administraciones anteriores, ocasionando el retraso de la obra por años.

La Troncal Amazónica con sus mil kilómetros de extensión, en los próximos dos años integraría de forma efectiva a la región con el eje multimodal Manta-Manaos, pues se podrá contar con una red de carreteras de primer orden, totalmente concluidas y en buen estado, enlazando a las seis provincias amazónicas, de norte a sur: Sucumbíos, Orellana, Napo, Pastaza, Morona Santiago y Zamora Chinchipe, y que a su vez conectan a la Región Amazónica con la Sierra Norte, Central y Sur, beneficiando a 550.00 usuarios aproximadamente.